科研系统在第二银河里分为舰船、武器、工程、电子、生产、指挥六大模块，首先是舰船核心系统，推荐玩家优先将处理器、反应堆发展至T2。其他的船体改造可以先不着急升级，因为船体改造升级后增加的是航船的黄色血条。黄色的血条是不增加护盾的，也就是说敌人对我方造成的伤害都是真实伤害，加了用处不大。黄色血条能承受的攻击连蓝色护盾的十分之一都不及，所以在航船的护盾要消失的时候，就说明航船要爆了。

接下来是能量系统基础和能量系统进阶，这两个科技是第二顺位的最佳选择。升级之后能够增加舰船的能量，能够给航船回复额外百分之十三点五的能量。除了能量的投射之外，其他的五个科技也都非常有用，若玩家喜欢玩pvp模式，那么在能量系统的科技上，就一定要及时升级，要不然在5-6阶段的虫洞扭曲干扰里会让玩家迅速没电。

第三顺位需要升级的科研是护盾系统基础和进阶，这两个科技主要增加的是航船的回充装置属性，能够提升玩家的回充量，减少回充装置的冷却时间。所有玩护盾系的玩家都需要优先升级护盾管理，其次选择护盾恢复，之后是回盾回充，最后两个升级护盾补偿和护盾保持。若玩家不想玩奶妈辅助流派，就可以不升级护盾投射科技。第四顺位需要升级护盾抗性基础和进阶，护盾系统可以提升玩家航船的护盾量。让玩家的护盾变得更加厚，护盾变厚就让玩家能够在战场上存活的越久。建议先全部点至T2，然后根据玩家自己的船型特点来进行后一步的升级。